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                非标记定量蛋白质组学

                Label-Free Proteomics

                非标记定量蛋白质组学
                非标记定量蛋白质组学

                Label-free 蛋白∴质组分析技术

                Label-free,即非标记定量技术,是通过液质〒联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,它克服了传统的同位素标记的缺点,即过高的样品浓※度 , 并且前处理少,更多保留样本最原始信息;对于低丰度多肽的覆盖程度更高;不受标记试剂盒限制,可进行大批量的样本检测。

                研究流程
                样本要求
                分析结果
                案例分析

                肌萎缩侧索硬化症脑脊液巨噬细胞生物标志物

                Cerebrospinal fluid macrophage biomarkers in amyotrophic lateral sclerosis

                期刊:Annals of Neurology     影响因子:9.037
                发表时间:2018年     发表单位:英国牛津大学临床神经科学系

                研究背景

                神经退行性疾病肌萎缩侧索硬化症 (ALS) 是一种涉及多种分子途径的异质性临床综合征。

                研究方法

                我们使用高通量蛋白质组学方法来识别单个脑脊液样本,发现几丁质酶 CHIT1、CHI3L1 和 CHI3L2 水平与 ALS患♂者疾病程度相关。

                研究结果

                3 种巨噬细胞来源的几丁质酶在 ALS 中含量增『加:几丁糖苷酶 (CHIT1)、几丁质酶 -3 样蛋白 1(CHI3L1) 和几丁质酶 -3 样蛋白 2(CHI3L2)。

                图 1 差异蛋白含量及 ROC 曲线

                图 2 差异蛋白与疾病进展的相关性分析

                结论

                CHI3L1 升高是 ALS 和 PLS 的共同特征,而 CHIT1 和 CHI3L2 水平不同。几丁质酶水平与疾病进展率相关 CHIT1、CHI3L1 和 CHI3L2 水平与磷酸【化神经丝重链相关。在低初始水平的人群中,CHI3L1 水平随时间增加,但 CHIT1或 CHI3L2 水平不◤随时间增加。CHIT1 值高与生存期缩短相关。

                参考文献

                Thompson A G ,Gray E ,Marie-La?titia Thézénas, et al. Cerebrospinal fluid macrophage biomarkers in amyotrophic lateral sclerosis[J]. Annals of Neurology, 2018, 83(2)