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                标记定量蛋白质组学

                TMT/iTRAQ Proteomics

                标记定量蛋白质组学
                标记定量蛋白质组学

                TMT/iTRAQ 定量蛋白质组表达谱分析

                iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation) 和 TMT(Tandem Mass Tags) 技术是分别由美国 AB Sciex 公司和 Thermo 公司研发的多肽体外标记定量技ㄨ术。不同标记试剂与来源于不同样品胰酶消化后的肽〇段结合,经过色谱分离,并通过一级质谱●和二级质谱。平衡基团在二级质谱时发生中性丢失,而报告基团@在二级质谱低质量区域产生多个报告离子,其信号强度分别代表该标记样品♀的表达量,根据报告离子的峰面积计算同一蛋白质同一肽段在不同样品间的♀比值,从而实现蛋白的相对和绝对定量。

                研究流程
                应用领域
                ● 覆盖度高 ● 样本①类型不限 ● 定量准、重复性好 ● 一次上机、避免批次间误差
                样本要求
                分析结果

                蛋白互作网络图

                差异蛋白 Pathway 富集

                差异№蛋白火山图



                案例分析

                【项目文章】肝癌干预分子机制——独立于经典 Akt 的新路径发现

                The AKT-independent MET–V-ATPase–MTOR axis suppresses liver cancer vaccination

                期刊:Signal Transduction and Targeted Therapy     影响因子:13.493
                发表时间:2020年8月     发表单位:浙江大学

                研究背景

                由于∑ 高致死率,肝癌的早期诊断和治疗仍是目前难点。主要在于疫苗接种被认为∏是预防和辅助治疗的一种理想手段,但目前没有正〓式推行的肝癌疫苗,对肝癌的免疫原性抑制分子机制不明。文章关注到和肝癌免疫♀原性重点相关的 MET 蛋白,并发现了独立于经典 MET–AKT–MTOR 通路外的 MET–V-ATPase–MTOR 路径,和其在肝癌干预中潜在作用。

                图 1 研究路线

                图 2 V-ATPase 被鉴定为 MTOR 复合物▂中与 MET 相【互作用的新蛋白

                结论

                文章发现 MET 能作为“把关者”抑制肝癌细胞免疫原」性,蛋白质组检测发现其独立于经典◤ Akt 通路外的下游作▆用靶点 V-ATPase,而抑制 MET–V-ATPase–MTOR 通路后,肝癌保护效用明显加强,结论为肝癌药物干预的靶点及其候选药物提供了理论参考。

                参考文献

                Huang Xing,Xu Xingyuan,Wang Xun et al. The AKT-independent MET-V-ATPase-MTOR axis suppresses liver cancer vaccination.[J] .Signal Transduct Target Ther, 2020, 5: 122